大部分藥材不能暴曬，因此在其涼干及保存過程中，特別容易發霉變質，尤其在濕度較大的西南地區。用微量硫磺熏蒸、烘干藥材是國內藥材加工、保存的傳統工序之一，也是目前使用比較普遍的方法。該方法有利于中藥材的存儲以及保持藥效的穩定，也有一部分藥材是為了保證產品色澤美觀。但硫磺過量、反復熏蒸，會嚴重影響到藥材的品質，部分重金屬殘留量多者也危及到人體健康。

硫磺熏蒸也越來越影響著我國藥材的出口。韓國對藥材含硫量要求最為嚴格。2007年9月，韓國發布了《關于草藥中重金屬的規范和測試方法》修正提案，此后又發布了《關于草藥中二氧化硫殘留物的規范和測試方法》的修正提案，把72種草藥中二氧化硫的最高限量修訂為每千克30毫克，這個新的含量標準大大低于修改之前的標準。受此影響，2008—2009年，我國對韓國中藥材出口量連續2年下降。美國對我國中藥材出口的主要門檻并不是農藥殘留標準，而是有關重金屬的規定過于苛刻。2009年，中藥材對美總體出口量與上年同期相比下降了16.6%。

雖然國家食品藥品監督管理局曾經發文，要求治理硫磺熏蒸的問題，2010年版的國家藥典也提出了檢測藥材二氧化硫含量的方法，但是，在沒有更好的藥材保存方法的前提之下，藥農和藥材經營商也只能采取硫磺熏蒸的辦法。此后雖然有人提出低溫烘干技術和標準化倉儲可以保證中藥材無硫磺保存，但因其建設成本較高，操作復雜而得不到推廣。

近期，有人發現采用肉桂醛代替硫磺進行熏蒸，能取得非常好的效果。肉桂醛抗菌廣譜，對霉菌抑制作用更為突出。利用肉桂醛熏蒸，能很好地防止藥材發霉變質，保存時間也更為長久。肉桂醛綠色安全，對人體沒有任何危害，其綜合成本也相對低廉。利用肉桂醛熏蒸，在藥材上檢測不到重金屬等有害殘留，也非常有利于提高藥材的出口價格。